Основни задатак свих делатности центра је унапређење здравља становништва.
Такав циљ постиже се путем унапређења стања животне средине, уз интердисциплинарни и превентивни приступ. Центар се бави мерењем, анализом и праћењем микробиолошких, физичких и хемијских фактора животне средине који могу, посредно или непосредно, утицати на здравље становништва.
Наведене активности се односе на мониторинг фактора животне средине: воду за пиће, површинске и подземне воде, отпадне воде, воде за рекреацију, животне намирнице, предмете опште употребе, ваздух, земљиште, праћење хигијенско-санитарних прилика у установама од јавног значаја и унапређење исхране становништва.
Осим идентификације, обављају се процене и праћења фактора ризика по здравље становнштва, Центар даје препоруке мера које смањују или сузбијају неповољне факторе или утицаје на здравље становништва.
Центар својим здравствено васпитним активностима промовише здраве стилове живота.
Центар води евиденције, прикупља и обрађује податке и извештава надлежне државне службе, службе локалне самоуправе, здравствене установе о резултатима рада у појединим сегментима, као и јавност, путем средстава јавног информисања.
Ужи делокруг рада Центра :
- Контрола квалитета и здравствена безбедност воде за пиће, животних намирница, предмета опште употребе, ваздуха, површинских и отпадних вода
- Испитивање хемијских својстава земљишта
- Контрола и унапређење хигијенско-санитарног стања основних школа и предшколских установа
- Еколошки и хигијенско-санитарни надзор јавних објеката
- Едукација о управљању медицинским отпадом
- Учешће у организацији и спровођењу кампања из области промоције здравља
Послови из делокруга Центра за хигијену и хуману екологију обављају се у оквиру :
- одељења за хигијену
- хемијског одељења
Одељење за хигијену
- одсек за заштиту животне средине и здравствену безбедност воде
- одсек за исхрану и здравствену безбедност хране
- одсек за пријем узорака и санитарни надзор
Хемијско одељење
- одсек за испитивање пијаћих вода
- одсек за испитивање отпадних вода
- одсек за испитивање намирница и предмета опште употребе
- одсек заиспитивање ваздуха